MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidithiobacillus caldus SM-1 megaplasmid

Total Repeats: 4834

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_015851	CTG	2	6	78328	78333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1502	NC_015851	GCAT	2	8	78347	78354	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1503	NC_015851	CCCG	2	8	78419	78426	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1504	NC_015851	TGA	2	6	78476	78481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_015851	CAT	2	6	78499	78504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1506	NC_015851	CTTC	2	8	78597	78604	0 %	50 %	0 %	50 %	340783703
1507	NC_015851	TTGG	2	8	78689	78696	0 %	50 %	50 %	0 %	340783703
1508	NC_015851	TCA	2	6	78747	78752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783703
1509	NC_015851	GCA	2	6	78767	78772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783703
1510	NC_015851	TGG	2	6	78818	78823	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_015851	TCC	2	6	78847	78852	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1512	NC_015851	TAG	2	6	78873	78878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_015851	GAT	2	6	78889	78894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_015851	ATA	2	6	78903	78908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_015851	TGA	2	6	78982	78987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783704
1516	NC_015851	C	6	6	78992	78997	0 %	0 %	0 %	100 %	340783704
1517	NC_015851	TC	3	6	79030	79035	0 %	50 %	0 %	50 %	340783704
1518	NC_015851	CCAA	2	8	79097	79104	50 %	0 %	0 %	50 %	340783704
1519	NC_015851	TGCCC	2	10	79168	79177	0 %	20 %	20 %	60 %	340783704
1520	NC_015851	GCC	3	9	79272	79280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783704
1521	NC_015851	TGT	2	6	79333	79338	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340783704
1522	NC_015851	AAT	2	6	79380	79385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_015851	CCT	2	6	79396	79401	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1524	NC_015851	CGC	2	6	79512	79517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783705
1525	NC_015851	GGC	2	6	79626	79631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783705
1526	NC_015851	AGC	2	6	79682	79687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783705
1527	NC_015851	AGAA	2	8	79688	79695	75 %	0 %	25 %	0 %	340783705
1528	NC_015851	CAC	2	6	79780	79785	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783705
1529	NC_015851	GCG	2	6	79855	79860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783705
1530	NC_015851	GCG	2	6	79900	79905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783705
1531	NC_015851	AGG	2	6	79925	79930	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340783705
1532	NC_015851	GC	3	6	79939	79944	0 %	0 %	50 %	50 %	340783705
1533	NC_015851	CGG	2	6	79989	79994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783705
1534	NC_015851	GCC	2	6	80005	80010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783705
1535	NC_015851	AGG	2	6	80072	80077	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340783705
1536	NC_015851	CAT	2	6	80101	80106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783705
1537	NC_015851	CCA	2	6	80119	80124	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783705
1538	NC_015851	GCA	2	6	80136	80141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783705
1539	NC_015851	TCC	2	6	80197	80202	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1540	NC_015851	CCG	2	6	80273	80278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783706
1541	NC_015851	ACCGTG	2	12	80464	80475	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	340783706
1542	NC_015851	AACCA	2	10	80477	80486	60 %	0 %	0 %	40 %	340783706
1543	NC_015851	CGCC	2	8	80499	80506	0 %	0 %	25 %	75 %	340783706
1544	NC_015851	CCG	2	6	80564	80569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783706
1545	NC_015851	CGC	2	6	80592	80597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783706
1546	NC_015851	CGC	2	6	80599	80604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783706
1547	NC_015851	GCGGG	2	10	80613	80622	0 %	0 %	80 %	20 %	340783706
1548	NC_015851	CAA	2	6	80626	80631	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340783706
1549	NC_015851	CAT	2	6	80713	80718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783706
1550	NC_015851	ACG	2	6	80724	80729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783706
1551	NC_015851	GTCCAA	2	12	80836	80847	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	340783706
1552	NC_015851	C	6	6	80899	80904	0 %	0 %	0 %	100 %	340783706
1553	NC_015851	AAT	2	6	80927	80932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340783706
1554	NC_015851	CAT	2	6	80941	80946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783706
1555	NC_015851	TCC	2	6	80950	80955	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340783706
1556	NC_015851	CG	3	6	81003	81008	0 %	0 %	50 %	50 %	340783706
1557	NC_015851	CAT	2	6	81010	81015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783706
1558	NC_015851	GCC	2	6	81099	81104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783707
1559	NC_015851	GGC	2	6	81114	81119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783707
1560	NC_015851	TCA	2	6	81128	81133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783707
1561	NC_015851	ATG	2	6	81160	81165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783707
1562	NC_015851	CCAC	2	8	81175	81182	25 %	0 %	0 %	75 %	340783707
1563	NC_015851	GCA	2	6	81218	81223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783707
1564	NC_015851	GCC	2	6	81284	81289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783707
1565	NC_015851	GGA	2	6	81290	81295	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340783707
1566	NC_015851	CAC	2	6	81321	81326	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783707
1567	NC_015851	CCG	2	6	81335	81340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783707
1568	NC_015851	CGCC	2	8	81344	81351	0 %	0 %	25 %	75 %	340783707
1569	NC_015851	CCG	2	6	81418	81423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783707
1570	NC_015851	GAT	2	6	81450	81455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783707
1571	NC_015851	CAG	2	6	81504	81509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783707
1572	NC_015851	GGC	2	6	81543	81548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783707
1573	NC_015851	CCT	2	6	81592	81597	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340783707
1574	NC_015851	GACG	2	8	81602	81609	25 %	0 %	50 %	25 %	340783707
1575	NC_015851	CGC	2	6	81621	81626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783707
1576	NC_015851	GAC	2	6	81695	81700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783707
1577	NC_015851	TGT	2	6	81701	81706	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340783707
1578	NC_015851	TGGC	2	8	81719	81726	0 %	25 %	50 %	25 %	340783707
1579	NC_015851	CCT	2	6	81727	81732	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340783707
1580	NC_015851	GGT	2	6	81879	81884	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783707
1581	NC_015851	CGC	2	6	81893	81898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783707
1582	NC_015851	GCGG	2	8	81948	81955	0 %	0 %	75 %	25 %	340783707
1583	NC_015851	CGGT	2	8	81964	81971	0 %	25 %	50 %	25 %	340783707
1584	NC_015851	ACG	2	6	81976	81981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783707
1585	NC_015851	AT	3	6	81982	81987	50 %	50 %	0 %	0 %	340783707
1586	NC_015851	GCC	2	6	81990	81995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783707
1587	NC_015851	C	6	6	82092	82097	0 %	0 %	0 %	100 %	340783707
1588	NC_015851	CAC	2	6	82269	82274	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783707
1589	NC_015851	CTG	2	6	82380	82385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783707
1590	NC_015851	GCC	2	6	82396	82401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783707
1591	NC_015851	AGC	2	6	82444	82449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783707
1592	NC_015851	GTA	2	6	82500	82505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783707
1593	NC_015851	AGC	2	6	82519	82524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783707
1594	NC_015851	GC	3	6	82552	82557	0 %	0 %	50 %	50 %	340783707
1595	NC_015851	GGA	2	6	82625	82630	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340783707
1596	NC_015851	GGC	4	12	82686	82697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783707
1597	NC_015851	GCG	2	6	82724	82729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783707
1598	NC_015851	CTC	2	6	82743	82748	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340783707
1599	NC_015851	GCC	2	6	82749	82754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783707
1600	NC_015851	AGGA	2	8	82771	82778	50 %	0 %	50 %	0 %	340783707
1601	NC_015851	GAT	3	9	82785	82793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783707
1602	NC_015851	GAA	2	6	82800	82805	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340783707
1603	NC_015851	GACC	2	8	82814	82821	25 %	0 %	25 %	50 %	340783707
1604	NC_015851	TCC	2	6	82822	82827	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340783707
1605	NC_015851	GCC	3	9	82840	82848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783707
1606	NC_015851	CATC	2	8	82913	82920	25 %	25 %	0 %	50 %	340783707
1607	NC_015851	CGATGG	2	12	82928	82939	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	340783707
1608	NC_015851	GCC	2	6	82944	82949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783707
1609	NC_015851	ATG	2	6	82957	82962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783707
1610	NC_015851	GGC	2	6	82998	83003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783707
1611	NC_015851	CGA	2	6	83024	83029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783707
1612	NC_015851	CCA	2	6	83033	83038	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783707
1613	NC_015851	CG	4	8	83047	83054	0 %	0 %	50 %	50 %	340783707
1614	NC_015851	CAG	2	6	83055	83060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783707
1615	NC_015851	TTC	2	6	83094	83099	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340783707
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1617	NC_015851	GTG	2	6	83158	83163	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783707
1618	NC_015851	AGGG	2	8	83185	83192	25 %	0 %	75 %	0 %	340783707
1619	NC_015851	TGG	2	6	83221	83226	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783707
1620	NC_015851	GCC	2	6	83244	83249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783707
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1625	NC_015851	CTC	2	6	83447	83452	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340783707
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1995	NC_015851	ATCA	2	8	104611	104618	50 %	25 %	0 %	25 %	340783724
1996	NC_015851	GATG	2	8	104622	104629	25 %	25 %	50 %	0 %	340783724
1997	NC_015851	TCA	2	6	104658	104663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783724
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1999	NC_015851	ATC	2	6	104779	104784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783724
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